مراحل تولید هر دو محصول تا حدودی شبیه به هم می باشد و هر دو از یک فناوری خاص که همان خشک کردن شیر خام است بهره می برند با این تفاوت که در کارخانجات شیر خشک نوزاد سعی شده از شیر خام هایی با گرید بالا و کیفیت بسیار بالا چه از نظر شیمی و چه از نظر بار میکروبی استفاده شود .که این حساسیت در مراحل تولید هم بسیار بارز می باشد تا محصولی ارائه شود که برای نوزادان ، استاندارد کافی را داشته باشند .

تفاوت بعدی در میزان لاکتوز موجود در این دو شیر خشک می باشد که درشیر خشک  نوزادان نسبت به شیر خشک صنعتی  به دلیل حساسیت توزادان به لاکتوز و ایجاد مشکلات گوارشی ، لاکتوز شیر خشک از بین رفته ، اما در شیر خشک صنعتی ما حدودا 48 درصد لاکتوز موجود داریم .  غنی سازی یکی از اقدامات دیگری است که کارخانجات تولید شیر خشک نوزاد انجام میدهند تا کمبود تغذیه ای نوزادان جبران شود مثل ویتامین ها، آهن ، پتاسیم و…